Sciences de la vie - Métabolomique

La métabolomique fait référence à un ensemble de techniques utilisées pour détecter et analyser de manière exhaustive les résultats de divers métabolites produits par les organismes dans le cadre d'activités vitales. Les métabolites sont les conséquences les plus en aval de l'expression des gènes et, comparés aux gènes et aux protéines, reflètent directement les phénomènes de la vie en constante évolution en raison de leur proximité avec les phénotypes biologiques. Par conséquent, l’application de la métabolomique est utilisée dans un large éventail de domaines.

Mesure des métabolites et spectromètre de masse

Champs industriels

Métabolomique

Analyse complète

Comprehensive analysis​

L'analyse complète fait référence à une méthode de mesure et d'analyse d'autant de métabolites que possible sans restreindre la cible de l'analyse et est utilisée pour rechercher des biomarqueurs montrant des différences entre les échantillons. Des techniques de spectrométrie de masse telles que GC/MS et LC/MS, qui permettent une analyse simultanée de plusieurs composants, sont souvent utilisées. Les méthodes de balayage ont généralement été utilisées pour détecter autant de métabolites que possible par chaque instrument analytique. Mais il est devenu possible de mesurer les métabolites de plusieurs centaines de composants à la fois avec une sensibilité élevée en utilisant une large méthode d'analyse MRM sensible à la cible utilisant une base de données.

Une analyse complète utilisant MRM peut être facilement réalisée en utilisant notre base de données (package de méthodes LC/MS/MS pour les métabolites primaires ou base de données Smart Metabolites)

Analyse de la cible

Target analysis

Après avoir effectué une recherche de biomarqueurs à l'aide d'une analyse complète, l'analyse se concentre sur les composés hautement caractérisés et importants dans le diagnostic du métabolisme des médicaments, de la santé, des maladies, etc. Le ciblage peut améliorer considérablement la sensibilité de la détection et réduire le temps nécessaire à la mesure et aux données. analyse, permettant des études de cohorte de grande envergure avec des échantillons de plus grande taille.

Imagerie

Imaging

 

L'imagerie implique l'ionisation à la pression atmosphérique et l'utilisation d'une imagerie à haute résolution spatiale pour visualiser la distribution des concentrations de métabolites dans un échantillon tel qu'un tissu. Pour analyser par GC/MS ou LC/MS, l’échantillon doit être homogénéisé et il n’est pas possible de savoir comment la concentration du composé était initialement distribuée dans l’échantillon. La réalisation d'imagerie permet de mesurer la distribution des métabolites et permet l'analyse pharmacocinétique, la recherche sur les mécanismes pharmacodynamiques et pharmacologiques, la recherche DDS, la recherche de biomarqueurs et l'élucidation des mécanismes de la maladie.

Prétraitement

Pretreatment

La métabolomique, qui analyse les fluctuations métaboliques des organismes vivants, utilise un spectromètre de masse pour mesurer divers métabolites. Avant qu’un échantillon biologique puisse être mesuré, il doit être correctement prétraité. Le « Manuel de procédures de prétraitement métabolomique » présente des informations sur les procédures de prétraitement et les équipements utilisés pour le prétraitement lors des mesures GC-MS (/MS) et LC-MS/MS, ainsi qu'une multitude de photographies.

 

Base de données