Recherche de biomarqueurs par LCMS-IT-TOF

Recherche de biomarqueurs par LCMS-IT-TOF

■ Recherche de biomarqueurs métaboliques à l'aide de la combinaison de la spectrométrie de masse (MSn) de haute précision avec un outil d'analyse multivariée et de prédiction de formules

Les composés de faible poids moléculaire présents dans les échantillons biologiques, tels que les composants métaboliques, notamment les métabolites endogènes et les médicaments présents dans le sang et les tissus, sont d'importants candidats biomarqueurs.
Le chromatographe liquide-spectromètre de masse haute performance LCMS-IT-TOF offre des informations de masse très précises pour de nombreux métabolites. Ce système combine la séparation par un système LC optimisé avec un spectromètre de masse hybride haute performance (piège à ions quadripolaire (QIT)/temps de vol (TOF)).

L'analyse LCMS-IT-TOF des biomarqueurs dans le plasma sanguin d'un modèle de rat pour le diabète de type II (rat Zucker) est présentée ci-dessous.
L'échantillon prétraité a été analysé par LCMS-IT-TOF et une analyse des composants primaires à l'aide d'un logiciel d'analyse multivariée utilisé pour déterminer les différences entre les groupes de rats modèles de diabète normal et de type II.
Les différences quantitatives entre les deux groupes dans ces résultats ont ensuite été analysées, en se concentrant sur les composants lipidiques. Plusieurs chromatogrammes ioniques ont été tracés pour les valeurs m/z . Les informations de masse précises et MS ⁿ ont été appliquées à la prédiction de formules à l'aide du logiciel Formula Predictor et à l'identification des composés via une recherche dans une base de données.

Le logiciel Formula Predictor a donné une seule formule candidate, que la recherche dans la base de données a identifiée comme étant la 1-Palmitoyllysophatidylcholine. Les autres lipides ont été identifiés de la même manière.

Par conséquent, LCMS-IT-TOF peut obtenir des informations MS ⁿ avec une grande précision de masse. L'utilisation du logiciel Formula Predictor unique de Shimadzu sur ces informations MS ⁿ permet une identification précise de la formule de composition.

LCMS-IT-TOF

Le LCMS-IT-TOF est un spectromètre de masse à chromatographe liquide qui combine un chromatographe liquide haute performance avec un spectromètre de masse à piège à ions (IT) et un spectromètre de masse à temps de vol (TOF). Il combine les performances MS ⁿ du spectromètre de masse à piège à ions avec les mesures de masse haute résolution et haute précision du spectromètre de masse à temps de vol pour obtenir des mesures de masse très précises qui étaient inédites avec les LC/MS/MS classiques. .
Il s’agit d’un outil puissant pour rechercher des biomarqueurs de faible poids moléculaire.

Logiciel d'analyse métabolomique

Le logiciel d'analyse métabolomique Profiler ^TM AM ⁺ effectue une analyse statistique de l'énorme quantité de données obtenues par un spectromètre de masse. Il compare et superpose statistiquement deux ou plusieurs ensembles d'échantillons pour identifier les métabolites qui ont le plus grand effet sur les différences entre les ensembles d'échantillons.
Profiler ^TM AM ⁺ permet l'analyse des composants principaux (ACP) et l'analyse de clustering en comparant des ensembles et est idéal pour rechercher des composants (candidats biomarqueurs) présentant des changements caractéristiques à partir de grands volumes de données.
Voir le logiciel d’analyse structurelle des métabolites MetIDSolution pour la détection et l’identification complètes et à haut débit des métabolites.

Logiciel de prédiction de formule

Le logiciel offre bien plus que des formules de prédictions à partir de masses exactes. Il peut réduire le nombre de métabolites candidats en prenant en compte les modèles isotopiques candidats et les informations MS ⁿ .
Il offre une identification très fiable des compositions de métabolites.