Analyse des modifications post-traductionnelles | Analyse structurelle de la chaîne sucrière par MS

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Analyse des glycopeptides à l'aide des données de MS 6

L’analyse structurelle MS n des chaînes de sucre liées à l’Asn est présentée ci-dessous.
Dans le spectre MS/MS obtenu en utilisant le pic d'ion moléculaire [M+Na] + ( m/z 1999,8) dans le spectre MS comme ion précurseur, l' ion O,2 A 6 ( m/z 1562,6) de l'anneau croisé le clivage présente le signal le plus fort. Cependant, à ce stade, peu d’ions produits peuvent être détectés par MS/MS et des informations adéquates sur la séquence des chaînes de sucre ne peuvent pas être obtenues.

Fig. 1 Spectres MS et MS/MS de 10 BP

Si un spectre MS n est obtenu en utilisant l' ion O,2 An comme ion précurseur, des signaux forts devraient être observés pour [M-60] + ( 2,4 A n ion) et [M-120] + (B n-1 ). (Voir la demande AXIMA QIT n° 4.)
Par la suite, une analyse de la séquence de chaînes de sucre par MS n a été réalisée en utilisant m/z 1562,6 comme ion précurseur.

Fig 2. Spectres MS n（MS3 à MS6） de 10 BP

IDans le spectre MS 3 obtenu avec l' ion O,2 A 6 ( m/z 1562,6) comme ion précurseur, l' ion 2,4 A 6 ( m/z 1502,6) et l'ion B 5 ( m/z 1442,6) peuvent être observé, comme prévu. De même, dans le spectre MS4 obtenu avec l' ion B5 ( m /z 1442,6) comme ion précurseur, des ions produits comprenant des disaccharides à des heptasaccharides ont été détectés.
MS 5 avec m/z 1077,5 et MS 6 avec m/z 712,3 ont ensuite été réalisés pour observer les signaux monosaccharides ([Hex ou GlcNAc + Na] + ). Une telle procédure peut obtenir une grande quantité d’informations structurelles sur la chaîne des sucres à partir des spectres MS n .

Échantillons fournis par le Dr Yasuhiro Kajihara, École supérieure internationale des arts et des sciences, Université de la ville de Yokohama

Spectrométrie de masse MALDI-TOF

  • La Prominence nano LC permet une analyse très sensible de la chaîne du sucre. Le système unique de contrôle du flux de reflux améliore la reproductibilité de la séparation, et le logiciel dédié Nano-Assist simplifie l'automatisation et le réglage des paramètres.
  • AccuSpot ajoute automatiquement la matrice et repère les chaînes de sucre séparées par le système Prominence nano sur des plaques MALDI.
  • La séparation et la purification des mélanges de chaînes de sucre par Prominence nano réduisent la suppression des ions par les impuretés.
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