Analyse des modifications post-traductionnelles | Analyse structurelle de la chaîne sucrière par LCMS-IT-TOF

Analyse structurelle de la chaîne sucrière par LCMS-IT-TOF

■ Analyse des anticorps monoclonaux commerciaux de souris
 

Les chaînes de sucre, également appelées « troisièmes chaînes de la vie », attirent l'attention en tant que molécules d'information biologique. Les chaînes de sucre jouent des rôles importants dans des phénomènes biologiques tels que la transmission de signaux intercellulaires et la reconnaissance moléculaire et sont connues pour être impliquées dans le cancer ; maladie chronique; maladie infectieuse; anomalies immunologiques, cérébrales et développementales ; et la dégénérescence.
Les performances améliorées des spectromètres de masse permettent une analyse structurelle de la chaîne du sucre à haut débit, qui nécessitait auparavant beaucoup de temps.

L’analyse des anticorps monoclonaux de souris commerciaux est présentée ci-dessous.
Flux de tests et de recherche
1) Utilisez SDS-PAGE pour exciser les bandes correspondant aux anticorps du gel.
2) Digestion en gel par PNGaseF.
3) Purification et marquage des chaînes sucrées à l'aide du kit BlotGlyco (Sumitomo Bakelite).
4) Analyse MS ⁿ par Prominence nano et LCMS-IT-TOF.

La figure 1 montre les chromatogrammes de masse de m/z 696,7672, m/z 769,2833, m/z 850,3369 et m/z 930,9525.

Fig. 1 Chromatogrammes de masse Prominence nano / LCMS-IT-TOF

Les figures 2 à 5 montrent les spectres MS/MS utilisant les ions précurseurs des chromatogrammes de masse de la figure 1 ci-dessus. Les structures de la chaîne sucrée présentées dans les diagrammes ont été estimées à l’aide d’un logiciel de prédiction de la structure de la chaîne sucrée.

Spectromètre de masse par chromatographe liquide haute performance

• Le chromatographe liquide-spectromètre de masse haute performance LCMS-IT-TOF produit des informations MS ⁿ avec une précision de masse élevée, idéales pour l'analyse de la chaîne du sucre.
• Une combinaison du chromatographe liquide haute performance Prominence nano Nanoflow avec l'interface NES-100 NanoESI offre une analyse très sensible de la chaîne du sucre.
• La grande précision de masse du LCMS-IT-TOF permet une estimation très précise de la chaîne du sucre.
• L'enquête sur les pertes neutres évalue automatiquement les pertes neutres spécifiques prédéfinies dans le spectre MS ² et exécute les mesures MS ³ .
• Un logiciel dédié fournit un support puissant pour l’analyse structurelle des chaînes sucrières.